公司設立辦公室（黨辦、董辦）、組織人事部、黨建工作部、財務資產部、紀檢工作部、投資發展部、工程管理部、運營管理部、應急管理部、審計部、合規管理部11個部門。

       現有全資子公司1家：海南水務投資有限公司；控股子公司14家：定安、陵水、瓊中、屯昌、保亭、五指山、澄邁、臨高、儋州、昌江、白沙、東方、樂東、海控環保等14市縣水務（污水處理）公司；參股子公司3家：瓊海、萬寧、文昌市縣水務（污水處理）公司。

海南省水利電力集團有限公司     海南省水利水電勘測設計研究院有限公司

海南水務投資有限公司               澄邁縣水務有限公司                      白沙黎族自治縣水務有限公司

五指山水務有限公司                  屯昌縣水務有限公司                      樂東黎族自治縣水務有限公司

保亭縣水務有限公司                  儋州市松濤水利工程物資有限公司  海南省松濤建筑安裝工程有限公司

白沙城鄉水環境有限公司           海南松濤水庫綜合開發有限公司      海南鵬源水環境治理科技有限公司          

文昌市水務有限公司 

瓊海市污水處理有限公司

海南海控能源股份有限公司

三亞市海創水務環保有限公司

海南恒奧地下管線科技有限公司